Zyra Kombëtare e Auditimit ka zbuluar parregullsi të rëndësishme në Ministrinë e Arsimit, Shkencës, Teknologjisë dhe Inovacionit për vitin 2025, duke evidentuar shpenzime të regjistruara gabimisht në vlerë mbi 3.2 milionë euro. Raporti tregon se MASHTI ka paguar shpenzime në kategori ekonomike jo adekuate, ka nënvlerësuar pasuritë kapitale për më shumë se 1.14 milionë euro dhe nuk ka raportuar saktë detyrimet kontigjente. Auditorët kanë konstatuar gjithashtu probleme në procesin e pagesave, duke përfshirë vonesa deri në 11 muaj dhe mungesë të nënshkrimeve të autorizuara në disa pagesa, si dhe menaxhim të dobët të kontratave përmes platformës së e-prokurimit. Si pasojë, Zyra Kombëtare e Auditimit rekomandon përmirësimin e kontrollit të brendshëm financiar dhe menaxhimit të pasurive për të shmangur parregullsi të ngjashme në të ardhmen.