Në vitet 1989-1990, me ardhjen e Sllobodan Millosheviqit në krye të Serbisë, filluan përpjekjet e dhunshme për shkatërrimin e arsimit të lartë shqip në Kosovë, duke goditur rëndë Universitetin e Prishtinës. Në qershor të vitit 1991, Kuvendi i Serbisë miratoi masa represive që ndryshuan rrënjësisht përbërjen dhe funksionimin e universitetit, duke futur studentë serbë nga Serbia dhe Mali i Zi dhe duke marginalizuar studentët dhe profesorët shqiptarë. Në gusht 1991, grupi i Helsinkit në Vjenë deklaroi se arsimi shqip në Kosovë ishte në praktikë shkatërruar nga politika serbe. Megjithatë, në fillim të vitit 1992 u ndërmorën përpjekje për rifillimin e mësimit në shkollat shqipe nëpërmjet formave alternative, duke shënuar një fazë të re rezistence dhe mbijetesë të arsimit shqip në Kosovë.