Më 24 mars 1999, Çarshia e vjetër e Gjakovës u përfshi nga flakët në një natë të tmerrshme që shënoi hakmarrjen e pushtetit serb ndaj popullsisë civile pas fillimit të bombardimeve të NATO-s. Gjatë kësaj nate u vranë mizorisht dhjetëra civilë të pafajshëm, ndërsa për 78 ditë me radhë vazhduan vrasjet, dhunimet, djegiet dhe dëbimet masive në Gjakovë dhe në gjithë Kosovën. Çarshia, një kompleks i madh historik, kulturor dhe ekonomik, ku ushtroheshin dhjetëra zeje tradicionale, u shkatërrua plotësisht, duke humbur një nga qendrat më të rëndësishme të zhvillimit lokal. Pas luftës, falë ndihmës së organizatave ndërkombëtare, ajo u rindërtua dhe vazhdon të mbetet një simbol i trashëgimisë kulturore dhe historike të rajonit.